2024 年 7 月 25 日 4 时 54 分 39 秒 [12]，064 车自朱辛庄停车 场出库。5 时 5 分 9 秒，列车到达西二旗站。9 分 17 秒，司机将 列车运行模式由人工驾驶改为自动驾驶（41秒后改回人工驾驶）。 9 分 47 秒，064 车进入清河站库线。
5 时 10 分 10 秒，064 车速度降至 21.1 公里/小时 [13]，此时 距 5 号道岔 34.3 米、距停车标 20.91 米，司机依次实施 B2 级制 动 1 秒、B3 级制动 4 秒、B5 级制动 1 秒 [14]。10 分 16 秒，064 车 越过信号机，信号系统施加紧急制动，此时速度为 9 公里/小时 [15]，距 5 号道岔 9.08 米。10 分 19 秒，064 车停稳，此时车头越 过停车标 7.49 米，越过信号机 4.75 米，距 5 号道岔岔尖 2.84 米。
5 时 10 分 32 秒，车载信号系统提示“要求进入 RM 模式” “车头越过 MA 终点” [16]。10 分 38 秒，司机呼叫调度指挥中心， 报告“064 车要求进入 RM 模式”，未得到应答。10 分 50 秒，司 机再次向调度指挥中心报告“064 车要求进入 RM 模式”。10 分 59 秒，辛某询问 064 车位置，司机观察现场情况后回复“我在 清河库线信号机前面了”，随后补充报告“车头越过 MA 终点”。 11 分 26 秒，赵某指导辛某告知司机“064，你到清河的上行站 线是空闲的啊，可以看信号发车”；司机回复“好的，收到”。 5 时 11 分 41 秒，司机手动确认列车降级为限制人工驾驶模 式，信号机显示红灯。11 分 46 秒，064 车以限制人工驾驶模式 行进。11 分 47 秒，道岔开始转动。11 分 48 秒，064 车 1 号车 厢第 1 转向架经过道岔驶向下行轨道。11 分 52 秒，车辆出现震动和异响。11 分 55 秒，道岔转换到位。11 分 56 秒，064 车 1 号车厢第 2 转向架经过道岔驶向上行轨道。
5 时 12 分，064 车 1 号车厢第 2 转向架脱轨。12 分 04 秒， 司机操作列车紧急制动停车。此时，064 车车头侵入下行正线限 界约 1 米，影响正线运营。
